ヨハネ１章１８節は「ふところにいる」という位置関係で御父である神と御独り子であるイエス・キリストとの親密な関係を表現する。１３章２５節で主に「（裏切ろうとしている一人、）それは誰ですか」と質問した弟子はまさに同じ位置関係で、この弟子が主から特に目を掛けられた存在であると示唆する。

（注）別エントリー「試論：『ふところ』を１４０文字以内で」も参照のこと。
http://josephology.me/app-def/S-102/wordpress/archives/8816

【追記】

主は御受難の際、ヨハネに母を託された。このことで聖母には主以外に子がないとわかるが、ルツ記のように「近くの他人より遠くの親戚」の聖書世界では愛弟子というだけで師の母親を引き取るのは不自然で、ヨハネの母が「母の姉妹」（ヨハネ１９章２５節）つまり聖母の親族である蓋然性は否定できない。

（注）別エントリー「イエスの『兄弟』『姉妹』：同胞か親戚か」も参照のこと。
http://josephology.me/app-def/S-102/wordpress/archives/1451

福音書は主イエスの「兄弟姉妹」の存在を記すが、主は御受難の際、母を弟子ヨハネに託された。古代イスラエルでは師の死後その母の面倒を見るのは本来、弟子でなく遺族の責務である。ヨハネは自分の母を「母の姉妹」（ヨハネ１９章２５節）と記す。古代イスラエルで「兄弟姉妹」は親族全般を意味した。

ヨハネは大祭司が自分の存在を認識していた（ヨハネ１８章１５節）と記す。大祭司がガリラヤの漁師の息子をなぜ、認識していたのか？　理由として可能性が大きいのは、ヨハネの母が聖母の母アンナやエリサベトと同様、祭司族出身の女性だったためと推定され、母方が祭司族という点で、皆が遠縁だった。

（注）別エントリー「試論：『清めの水』を１４０文字以内で」も参照のこと。
http://josephology.me/app-def/S-102/wordpress/archives/13744